| 제작사명 / 모델명 |
ThermoFisher Scientific / KingFisher™ Duo Prime Purification System |
| 설치장소 |
부산광역시 금정구 오륜대로 57 보건과학관 (층: 5층 / 호실: 513호)
지도보기
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| 사용용도 |
분석 |
| 장비설명 |
유전체 염기서열 분석 서비스 제공
- 본 사업에서 유전체실증분석실은 관련 산업체, 의료기관 및 공공기관을 대상으로 유전체 염기서열 분석 서비스를 제공할 예정임.
- 유전체 염기서열 분석을 위해 Sanger sequencing에 기반을 둔 장비는 법증거물분석실(보건과학관 512호)에 기 구축하였으나 고도화 염기서열 분석을 위해 NGS 장비를 추가적으로 구축하여 지역 바이오헬스 산업체의 실증 분석 서비스를 보다 고도화하여 제공하고자 함.
◦ 유전체 염기서열 분석 연구 및 기술 개발 활용
- 본 장비는 Amplicon 분석, batcterial whole genomic 분석, shotgun metagenomic 분석, Eukaryotic RNA 분석 등 다양한 염기서열 분석 연구에 활용할 수 있음.
- 이를 바탕으로 교원 및 연구원의 유전체 분석 연구에 활용하여 학술발표, 논문게재, 지식재산권 창출 등 다양한 연구 및 기술개발 분야 실적을 신장시키고자 함.
◦ 학생 및 대학원생 대상 유전체 분석 교육 활용
- 본 장비는 현재 진단의료 분야에 적용되어 활용되고 있으며 유전체 분석을 통해 미리 질병의 발병 여부를 예측하고 동시에 환자 맞춤형 진료 및 약물 처방 등 다양한 분야에 활용되고 있음.
- 따라서 본 장비를 활용한 학생 및 대학원생 교육을 통해 진단의료 분야의 취‧창업 역량을 강화하여 경쟁력을 확보하고자 함.
◦ 체외진단 의료기기(분자유전진단 분야) 분야 재직자 대상 교육 활용
- 현재 의료기관 및 진단검사업체에서는 본 장비를 활용한 유전체 분석 서비스를 제공하고 있으며 관련 산업체에 재직하고 있는 경우 이와 관련한 업무 역량을 필요로 하고 있음.
- 본 실증분석실 내 기 구축된 장비와 함께 본 장비를 활용한 검사 기법에 대한 교육 서비스를 제공하여 지역사회 내 보건의료 관련 분야 재직자의 업무역량을 강화하고자 함. |
| 구성 및 성능 |
장비의 구성(Configurations of Goods)
1. 자동화 염기서열분석시스템
2. 라이브러리 자동화 준비 시스템
3. 악세사리
성능 및 규격(Performance and Specification)
1. 자동화 염기서열분석 시스템
(1) 이 시스템은 반도체 기반의 시퀀싱 기술과 생화학 반응 정보를 디지털 결과로 전환시키는 기술이 결합되어 있으며, 염기서열 분석과 해석이 일선 실험실 또는 검사실에서 가능하다. 이 시스템의 사용법은 매우 간단하며, DNA합성 중에 나오는 수소이온을 이용하기 때문에 DNA 염기분석을 위한 별도의 광학시스템이 필요하지 않고, 형광물질이 필요하지 않다. 실시간으로 시퀀싱이 진행되어 2~4시간 안에 시퀀싱 진행 결과를 확인할 수 있다.
(2) 성능
1) 구성방식 : 반도체 칩
① Ion 510 chips : 2 ~ 3 million
② Ion 520 chips : 3 ~ 5 million
③ Ion 530 chips : 15 ~ 20 million
④ Ion 540 chips : 60 ~ 80 million
2) 처리량
① Ion 510 chips : 0.3 ~ 1.0 Gb
② Ion 520 chips : 0.6 ~ 2.0 Gb
③ Ion 530 chips : 3.0 ~ 8.0 Gb
④ Ion 540 chips : 10.0 ~ 15.0 Gb
3) 분석길이 : 200 or 400 or 600 base single fragment reads
4) 정확도 : >99.99% consensus accuracy and >99.5% raw accuracy
5) 염기서열분석 시간 : 22시간 이하
6) 샘플 전처리 방법 : emulsion PCR system과 enrichment system
7) 적용 가능한 시료
① Genomic DNA
② Amplicon
③ RNA(cDNA)
8) 다중 샘플 처리 : 바코드를 붙여 384 샘플까지 실험 가능
(3) 적용분야
1) RNA sequencing
2) De novo sequencing
3) Genome sequencing
4) Gene sequencing
5) ChIP-Seq
6) Metagenomics sequencing
7) Whole Exome sequencing
(4) 운영 환경 (실내에서만 사용 가능)
1) 온도 : 20~30℃
2) 습도 : 40~60%, non-condensing
3) 고도 : < 2,000m
(5) 전원
1) 전압 : 100~240V
2) 전류 : 14.5A (Max) 또는 동등
3) 주파수 : 50/60Hz
2. 라이브러리 자동화 준비 시스템
(1) 성능
1) 라이브러리 자동화, 템플레이트 자동화 지원
2) 셋업 시간 : 15 분 이하
(2) 칩 호환성
1) 510 chip, 520 chip, 530 chip, 540 chip 모두 지원
(3) 작동 환경
1) 온도 : 20 – 25℃ 또는 동등
2) 습도 : 40 - 60%, non-condensing 또는 동등
(4) 무게 : 68kg (free standing) 또는 동등
(5) 전력
1) 전압 : 100 – 240V(max)
2) 전류 : 14A(max) 또는 동등
3) 주파 : 50/60Hz
4) 최대전력 : 1,350W(max) 또는 동등
3. 부속품 (Accessories)
- Standard accessories |
| 사용 예시 |
- |